Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb4P10284 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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