Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wipf3P0C7L0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Wipf3P0C7L0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms