Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb2P0C1T1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms