Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxc9P09633 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc9P09633 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms