Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms