Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa5P09021 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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