Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms