Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna5P07349 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms