Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnfP06804 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TnfP06804 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TnfP06804 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnfP06804 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnfP06804 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TnfP06804 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TnfP06804 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TnfP06804 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TnfP06804 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TnfP06804 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnfP06804 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnfP06804 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TnfP06804 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TnfP06804 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TnfP06804 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms