Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa4P06728 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms