Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P04212 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04212 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04212 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04212 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04212 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04212 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms