Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tk1P04184 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tk1P04184 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tk1P04184 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tk1P04184 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tk1P04184 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tk1P04184 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms