Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01915 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01915 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01915 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01915 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01915 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01915 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01915 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01915 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01915 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01915 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01915 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01915 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms