Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01820 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01820 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01820 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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P01820 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01820 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01820 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01820 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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