Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01789 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01789 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01789 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01789 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01789 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01789 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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