Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01724 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01724 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01724 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01724 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01724 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01724 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms