Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01638 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01638 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01638 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01638 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01638 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01638 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01638 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01638 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01638 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01638 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms