Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna2P01573 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna2P01573 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna2P01573 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna2P01573 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms