Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ifna1P01572 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna1P01572 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms