Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4bP01029 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4bP01029 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4bP01029 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4bP01029 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4bP01029 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4bP01029 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4bP01029 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4bP01029 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4bP01029 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4bP01029 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4bP01029 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4bP01029 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4bP01029 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4bP01029 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4bP01029 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4bP01029 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4bP01029 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4bP01029 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4bP01029 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4bP01029 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C4bP01029 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4bP01029 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4bP01029 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4bP01029 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4bP01029 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms