Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CpdO89001 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CpdO89001 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CpdO89001 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CpdO89001 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CpdO89001 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CpdO89001 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CpdO89001 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CpdO89001 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CpdO89001 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CpdO89001 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CpdO89001 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CpdO89001 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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