Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda1O88958 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda1O88958 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms