Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
F11rO88792 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
F11rO88792 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
F11rO88792 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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F11rO88792 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F11rO88792 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F11rO88792 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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F11rO88792 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
F11rO88792 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F11rO88792 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F11rO88792 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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