Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1O88746 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1O88746 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tom1O88746 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1O88746 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tom1O88746 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tom1O88746 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tom1O88746 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms