Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cops6O88545 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms