Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms