Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnal1O88327 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnal1O88327 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms