Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm10509O88255 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm10509O88255 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm10509O88255 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm10509O88255 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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