Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf5O70191 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf5O70191 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf5O70191 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf5O70191 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf5O70191 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms