Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms