Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dsg2O55111 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms