Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms