Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms