Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6bO54951 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6bO54951 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms