Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TsksO54887 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TsksO54887 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TsksO54887 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TsksO54887 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TsksO54887 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TsksO54887 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TsksO54887 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TsksO54887 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TsksO54887 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms