Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms