Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DffaO54786 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DffaO54786 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DffaO54786 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DffaO54786 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DffaO54786 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DffaO54786 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DffaO54786 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DffaO54786 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DffaO54786 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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DffaO54786 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DffaO54786 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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DffaO54786 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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DffaO54786 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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DffaO54786 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms