Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Tnfrsf18O35714 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf18O35714 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Tnfrsf18O35714 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Tnfrsf18O35714 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tnfrsf18O35714 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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