Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms