Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CrcpO35427 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms