Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppef2O35385 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppef2O35385 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms