Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc1O35379 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc1O35379 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms