Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna6O35345 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna6O35345 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna6O35345 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna6O35345 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna6O35345 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Kpna6O35345 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms