Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f3O35261 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f3O35261 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms