Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Ptpn9O35239 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptpn9O35239 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ptpn9O35239 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptpn9O35239 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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