Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nedd9O35177 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Nedd9O35177 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Nedd9O35177 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Nedd9O35177 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Nedd9O35177 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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