Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitx3O35160 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms