Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SdcbpO08992 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms