Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Flot1O08917 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Flot1O08917 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Flot1O08917 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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