Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EllO08856 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EllO08856 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EllO08856 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EllO08856 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EllO08856 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EllO08856 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EllO08856 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EllO08856 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EllO08856 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EllO08856 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EllO08856 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EllO08856 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EllO08856 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EllO08856 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EllO08856 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms